L’oratorio di S. Maria Maddalena è sin dalle sue origini legato inscindibilmente all’antico ospizio medioevale per pellegrini. Questo è testimoniato sin dal 1169 quando l’oratorio, menzionato in un documento rogato sull’isola è chiamato: “S. Maria Maddalena et hospitale”. All'interno della chiesa si trovano porzioni di dipinti, tra cui l'affresco del catino absidale che raffigura le costellazioni o quello che rappresenta alcuni membri della famiglia Giovio che si offrono alla Vergine circondata da Santi, risalente al XVI secolo.